Dalam dunia pasca-apokaliptik yang dikuasai oleh alien-kapaliran 'Machine Lifeforms, kemanusiaan sedang mempersiapkan untuk berdiri terakhir. Dipaksa untuk mundur ke Bulan untuk keselamatan, manusia menyematkan harapan mereka pada sekelompok android buatan manusia yang dikenal sebagai tentara YoRHa. Dipimpin oleh pertempuran serbaguna android YoRHa 2-gou B-gata 2B, kelompok akan berjuang untuk mengambil kendali Bumi kembali dari penjajahnya. Ketika perang melawan mesin berkecamuk, YoRHa perlahan mulai melihat pecahan kebenaran pertama yang mendasari konflik brutal. Menghadapi kenyataan yang keras di depannya, prajurit yang tak tergoyahkan 2B mulai mempertanyakan keberadaannya dan betapa dia harus berkorban demi kemanusiaan.