Dalam perang, sekelompok prajurit bernama Ninku berjuang melawan Tentara Kekaisaran dan hampir memusnahkannya. Tapi pada akhirnya, Ninku kalah dan hancur. Setelah perang, tentara kekaisaran mendirikan diri sebagai pembela rakyat dengan bantuan propaganda. Mereka juga berhasil membuat orang berpikir kalau Ninku adalah penjahat dan memulai perang. Fusuke terlihat seperti anak kecil tapi dia mantan kapten divisi Ninku pertama. Ibunya diculik selama perang dan setelah Ninku dikalahkan, dia pergi dalam perjalanan untuk menemukannya. Dalam perjalanannya dia bertemu Aicho dan Touji, keduanya juga mantan kapten Ninku, dan bersama-sama mereka berjuang melawan tentara kekaisaran yang tersisa yang tersisa. Ninja adalah sebuah klan ninja punah yang memerintahkan teknik esoterik dan kuat, maka banyak kelompok lain terus mencoba untuk mencuri teknik mereka untuk mengambil alih negara ini. Target utama mereka adalah Fusuke, seorang anak yang aneh tapi salah satu Ninku yang paling kuat. Fusuke, bersama Ninja lainnya dengan spesialisasi yang berbeda harus melawan ancaman yang menyebabkan jatuhnya dari Klan Ninku. (Sumber: ANN)