Bercerita Seorang kolektor serakah, Gelardan, ingin menangkap Pokemon Legendaris, Lugia. Tapi untuk melakukannya, dia harus menangkap Dewa Api, Dewa Es, dan Dewa Listrik. Dewa tersebut adalah Pokemon Legendaris, Fire, Thunder, dan Freezer. Satoshi, Kasumi, dan Kenji tengah dalam perjalananan mereka di Kepulauan Orange. Akan tetapi, di tengah perjalanan mereka, mereka terdampar di Pulau Earthia. Tidak lama kemudian, Satoshi dipilih sebagai Pengendali yang Hebat untuk mengumpulkan tiga pusaka.