Setahun dapat mengubah hidup seseorang selamanya. 365 hari Kelas 3-E SMP Kunugigaoka dihabiskan dengan guru eksentrik mereka, Koro-sensei, tentu saja. Membawa kenangan tahun itu dekat di hati mereka, alumni Nagisa Shiota dan Karma Akabane kembali ke kelas mereka sebelumnya untuk mengingat peristiwa saat penting dalam hidup mereka. Nagisa dan Karma diingatkan oleh ruangan, meja, papan tulis, dan album kelas yang familiar dari peristiwa yang membentuk mereka menjadi "pembunuh" dan mempersiapkan mereka untuk dunia nyata. Itu adalah warisan dari guru mereka yang mirip gurita—yang telah memperkenalkan dirinya dengan mengancam akan menghancurkan dunia jika mereka tidak membunuhnya pada akhir tahun ajaran—dan waktu yang dihabiskan di "Assassination Classroom" yang aneh namun luar biasa.