Suatu hari setelah sekolah, siswa SMA Yomogi Asanaka datang di bawah jembatan. Memperkenalkan dirinya sebagai Gauma, pengembara aneh memberitahu Yomogi bahwa dia adalah pengguna Kaiju, orang yang berurusan dengan "Kaiju" (monster yang membahayakan kota dan warga negara. Malam berikutnya, Yomogi berlari ke Gauma dan teman sekelasnya Yume Minami. Bersama, Kaiju muncul di daerah penduduk kota. Karena kurangnya pengalaman Gauma mengendalikan benda misterius dari kantong bersinar, memanggil robot raksasa yang dikenal sebagai Dynazenon. Meminta kerja sama empat orang, mecha menyeret Gauma, Yomogi, Minami, dan Koyomi Yamanaka, seorang pria pengangguran yang berkeliaran di jalan - ke kokpit. Pertemuan mereka dengan kaiju menandai awal dari keterlibatan mereka dengan eugenicis Kaiju, pengguna Kaiju yang memanipulasi Kaiju dengan niat buruk dan usaha mereka untuk membawa potensi penuh Dynazenon.