Setelah kematian ayahnya yang tak terduga, Momo Miyaura yang berusia 11 tahun meninggalkan Tokyo bersama ibunya dan pindah ke sebuah pulau terpencil tua di Laut Pedalaman Seto. Satu-satunya kenang-kenangan yang dia miliki dari ayahnya adalah surat yang belum selesai dengan hanya dua kata di dalamnya: "Dear Momo" -selalu dengan keributan hatinya dari situ.Di kota kecil yang baru dan asing itu, Momo dengan enggan mencoba menyesuaikan diri dengan bangunan kayu yang ketinggalan zaman, ladang tanaman sunyi, dan kuil-kuil terisolasi yang misterius. Suatu hari, saat menjelajahi loteng rumah barunya, dia menemukan buku gambar usang tentang youkai. Setelah penemuan ini, hal-hal aneh mulai terjadi di sekitar kota, dan Momo disambut oleh kedatangan tiga youkai yang bermasalah.Momo e no Tegami bercerita tentang seorang gadis muda saat dia berjuang untuk menyesuaikan diri dengan kehidupan barunya yang aneh dan akhirnya menyesuaikan diri dengan surat misterius ayahnya.